中国气象局广州热带海洋气象研究所前身是1976年成立的广东省热带海洋气象研究所,2001年经国家科技部、财政部、中央编制办公室批准转为国家非营利性科研机构。
从2002年开始,热带所开始了新一轮的改革,通过改革促进机制创新、制度创新,真正按照“开放、流动、竞争、协作”的方式运行,面向国内外招聘高层次人才,组建了一支年青的、学历层次高、科研能力强的科研队伍,组建新的领导班子,完善各项规章制度,增强激励机制,凝炼科学目标,通过5-10年左右的时间,将热带所建设成为具有一定国际影响的国家级热带海洋气象专业研究基地,气象科学技术研究成果向业务转化基地及高层次人才培养基地,逐步发展成为亚洲热带海洋气象研究和交流中心。